En la etapa de programación se definen los programas presupuestarios que tendrán a su cargo los diferentes Entes Públicos del Estado, así como los recursos necesarios para el cumplimiento de objetivos.
Los documentos que caracterizan esta etapa son:
Ambos se integran al Paquete Fiscal el cuál se presenta ante el H. Congreso del Estado de Michoacán.
De conformidad con el artículo 60 de la Constitución Política del Estado de Michoacán de Ocampo, el Gobernador deberá presentar cada año al Congreso, a más tardar el 21 de Noviembre las iniciativas de Ley de Ingresos y de Presupuesto de Egresospara el año siguiente.
Las EPP´s son otro elemento muy importante para la etapa de Programación. Constituyen un esquema de clasificación organizado del quehacer institucional, que permite vincular la misión y los objetivos al objetivo del gasto desagregado por Unidades Responsables, programas y proyectos en congruencia con el Pladiem.
Las EPP´s se conforman por 27 dígitos, los cuales están contenidos en la clasificación administrativa, unidad administrativa, clasificación funcional, acción de gobierno y clasificación programática de la clave presupuestaria.